Οι ξενώνες στη Σχοινούσα είναι κυρίως παραθαλάσσιες μονάδες που συνδυάζουν άνεση και αυθεντική κυκλαδίτικη φιλοξενία. Σε μικρή απόσταση από την παραλία Τσιγκούρι, τα καταλύματα προσφέρουν δωρεάν Wi-Fi, ιδιωτικό χώρο στάθμευσης και, συχνά, εστιατόριο με θαλασσινά. Οι τιμές είναι προσιτές για οικογένειες και ζευγάρια, ενώ η περιοχή γύρω από τη Χώρα (Παναγιά) θεωρείται ιδανική για πρόσβαση σε παραλίες και το λιμάνι Μερσίνη.
Ανάμεσα στα κορυφαία επιλεγμένα καταλύματα ξεχωρίζουν το Archipelagos Boutique Hotel, με βαθμολογία 96, πισίνα και δωρεάν μεταφορά από το αεροδρόμιο της Νάξου, και το Schinoza Luxury Suites (94) με εποχιακή πισίνα και κήπο. Τα Armonia και Filoxenia by Grispos Villas προσφέρουν παιδική χαρά και γυμναστήριο, ιδανικά για οικογένειες. Οι επισκέπτες μπορούν να απολαύσουν πρωινό με τοπικά προϊόντα και μασάζ κατόπιν κράτησης.